Penentuan Identitas Spesies Ikan Kerong-kerong yang Diperdagangkan di Pasar Beringin Kota Tarakan Berdasarkan Karakter Morfologi & Molekuler
Ikan kerong-kerong merupakan salah satu potensi sumberdaya perikanan yang bernilai komersial, ikan ini sering dirtangkap oleh nelayan yang menggunakan alat tangkap tugu dan pukat gondrong. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui identitas spesies ikan kerong-kerong yang diperdagangkan di pasar beringin kota Tarakan dengan menggunakan karakteristik morfologi dan molekuler. Florosafe DNA stain agar DNA teramati di bawah sinar UV, primer universal FishF1 (5’- TCAACCAACCCAAAGACATTGGCAC-3’) dan primer FishR1 (5’- TAGACTTCTGGGTGGCCAAA GAATCA-3’), untuk mendeteksi keberadaan DNA ikan secara universal, dan templet DNA sebagai cetakan untuk membentuk molekul DNA. Genomic DNA Mini Kit (Tissue Protocol). Sekuensing tersebut dicocokkan dengan database yang ada di Bank Gen NCBI juga terdapat 87 sekuen yang memiliki kemiripan berkisar 98.44 - 100.00%. Keragaman genetik ikan kerong-kerong yang tinggi mampu menyediakan keragaman respon yang penting untuk menjaga proses adaptasi spesies dalam perubahan kondisi lingkungan. Sekuen di penelitian ini ditemukan jarak genetik terdekat yaitu 0.000 yang berasal dari perairan Malaysia, India, Bangladesh dan Francis. Dari hasil BLAST sekuen ikan kerong-kerong yang berasal dari Pasar Beringin Kota Tarakan membentuk clade yang sama dengan ikan kerong-kerong yang berasal dari Malaysia, India, Bangladesh, dan Francis dengan nilai bootstrap 95.